芹菜软腐病是由胡萝卜软腐欧氏杆菌感染所致，病菌随病株残体在田间或堆肥中越冬。在适宜条件下，通过雨水、灌溉水及黄条跳甲、菜青虫等昆虫传播，从植株根部自然裂口、机械伤口或虫伤口侵入导管繁殖，引起初侵染和再侵染。该病除危害芹菜外，还可侵染胡萝卜、黄瓜及十字花科蔬菜等20多种作物。
发病盛期在5-11月，高温多雨年份发病重。连作田、低洼地、排水不良地块易发病；有机肥不足、播种过早、密度过大、通风不良、氮肥过量也会加重病情。苗期表现为心叶坏死腐烂呈烧心状；成株期主要危害叶柄基部、茎基部和茎部，初期出现水渍状淡褐色凹陷斑，后扩展为黄褐或黑褐色腐烂，有恶臭，干燥后变黑，仅残留表皮和维管束，严重时全株枯死。
病原菌为胡萝卜软腐欧文氏菌胡萝卜软腐致病变种，属细菌性病害。病菌在4-36℃均可存活，最适25-30℃，主要通过灌溉水、雨水、粪肥传播，经农事操作、虫害或冻害造成的伤口侵入。植株高大、田间荫蔽、湿度大时易发病。
