选用枸杞良种如宁杞1号，秋季落叶后及时清洁杞园，清除病叶和病果，集中深埋或烧毁以减少菌源。加强栽培管理，提倡施用日本酵素菌沤制的堆肥，增施磷、钾肥增强抗病力。定植前，棚室用硫磺熏蒸消毒，100米3空间用硫磺0.25千克，锯末0.5千克点燃熏蒸消毒。发病前或发病初期，喷湿27%高酯膜乳剂100倍液在叶面上形成一层薄膜组织病菌侵入或抑制菌丝生长。重病地与非寄主植物进行两年以上轮作，收获后及时彻底清除病残体并深翻土地。加强肥水管理，注意通风透光，降低棚室内湿度，防治植株徒长或早衰。进入6月开始喷洒70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液或75%百菌清可湿性粉剂600倍液、64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、30%绿得保悬浮剂400倍液，隔10天左右1次，连续防治2～3次，采收前7天停止用药。
