黄豆可以作为肥料，但需经过发酵处理才能使用。首先将黄豆用水浸泡约十小时，或用60度水浸泡四至五小时。然后将浸泡好的黄豆蒸熟或煮熟，开锅后继续加热20至30分钟，直至黄豆熟烂。待黄豆冷却后，放入大缸或塑料桶中密封，在向阳处发酵约20天即可使用。发酵后的黄豆肥可作为花肥、农肥或基肥，肥力充足。少量黄豆用作花肥时，可先温水泡三小时至表皮起皱，再加水煮15分钟至可碾碎，放凉后压碎装入带盖瓶中发酵。气温高时发酵时间约十几天，气温低则需更久。瓶内不宜装满，需留空隙，瓶口稍松。发酵后的肥水需稀释使用，豆渣可浅埋于花盆。未发酵的黄豆易招虫害，不宜直接使用。
