樱花根瘤病的肿瘤多发生在表土下根颈部、主根与侧根连接处或接穗与砧木的愈合处。肿瘤为不规则的圆球，初期为白色，质地柔软，表面光滑，随着病情加重逐渐变成深褐色，质地变硬，表面凹凸不平，像菜花一样。病原菌借助水流、地下害虫、嫁接工具、作业农具等从伤口侵入后形成瘤肿。病原细菌在病组织中越冬，存在于癌瘤表层，当癌瘤外层被分解后，细菌被雨水或灌溉水冲下进入土壤，能在土壤中存活很长时间。细菌可由嫁接伤口、虫害伤口入侵，土温在18－22℃时最适合癌瘤形成，一般经3个月表现症状。土壤和病株的病菌通过雨水、灌溉及修剪扩散传播。中性和微碱性土壤较酸性土壤发病重，重茬地及菜园地发病重。发病程度还与砧木品种有关。
