向日葵黑斑病和褐斑病是两种常见病害。黑斑病叶柄染病现圆形至椭圆形或梭形黑褐色病斑，严重时叶柄干枯。茎部染病生椭圆形至梭形长斑，黑褐色，由下向上蔓延，常互相连接，长的可达140mm，使茎秆全部变褐。花托染病生凹陷圆斑，花瓣染病产生小褐色斑，葵盘染病生圆形至梭形具同心轮纹的褐色至灰褐色斑，中心灰白色。向日葵褐斑病苗期染病，叶片上病斑为黄褐色圆形，直径2~5毫米。成株期病斑扩大，呈圆形或不规则多角形，直径可达5~15毫米，褐色，周围有黄绿色晕圈，褐斑上面密生小黑点。发病严重时病斑相连融合成片，叶片枯死。老龄叶片易感病，病害由下部叶片向上逐渐扩展。叶柄及茎上病斑黄褐色狭条形。防治方法：(1)选用抗病品种。(2)合理轮作，至少3年以上轮作期。(3)加强栽培管理，适期播种，合理密植，增施磷钾肥，增强植株抗病性，及时清理田间病残体。(4)药剂防治：①种子处理：50%福美双可湿性粉剂按种子量0.5%拌种。②发病初期可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1000倍液喷洒。黑斑病还可喷施75%百菌清可湿性粉剂800倍液、50%异菌脲可湿性粉剂1000倍液；褐斑病可喷施30%碱式硫酸铜胶悬剂400~500倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液。均为7~10天喷1次，喷2~3次。
