水稻立枯病主要发生在秧苗2～3叶期，此时胚乳将耗尽，抗寒力最差。当日均气温低于12～15℃时，秧苗生育受阻，抗病性显著下降，易受病菌侵染。若遇低温阴雨天气，极易发生立枯病。发病原因包括低温、温差过大、土壤偏碱、光照不足导致秧苗细弱、播种量过大等。田间症状表现为秧苗枯萎、易拔断，茎基部腐烂并有烂梨味，严重时整片死亡，病株基部常见赤色霉状物。
病原菌主要是镰刀菌和立枯丝核菌，属腐生菌，需在适生环境中才能侵入水稻。病害发生与秧苗生长环境不良导致抗病力下降密切相关。低温阴雨寡照是主要诱因，此时秧苗生长弱，而温度适宜病菌发育。陈种子活力差或浸种不当也会降低抗逆性。育苗床土壤粘重偏碱、播种过密、覆土过厚、管理不当均加重发病。
青枯病主要由通风炼苗不彻底或遇骤晴大风天气引起，秧苗幼嫩适应性差时易发。长期低温多雨和管理不当导致秧苗细弱、根系发育不良，天气转晴后叶片蒸腾失水过快，造成生理性青枯死亡。
