李子褐锈病主要危害叶片，发病初期叶背面出现褐色疱疹状小斑点，稍隆起，叶面相应处呈现褪绿小斑，逐渐变为黄色或黄红色。后期叶背病斑破裂，散出黄褐色粉末（夏孢子堆），秋后病部形成黑褐色或深栗色小点（冬孢子堆），严重时叶片早黄枯焦脱落。
李子褐斑病危害果实、花及枝条，以近成熟果实为主。果实发病初期产生淡褐色小斑点，迅速扩展为褐色腐烂，病部产生灰褐色绒状颗粒，病果易脱落。花受害后呈霜冻状变褐萎蔫，表层丛生灰霉，枯死后残留枝上。嫩叶染病后从叶缘向内扩展，变褐萎蔫。嫩枝受害形成长圆形溃疡斑，中央灰褐边缘紫褐色，常流胶，病斑绕枝一周后上部枝梢枯死。
