向日葵褐斑病初次侵染来源主要是遗留在田间的病残体，及时拔除病株，带出田外深埋，收获后清除病残体并烧毁或深埋，减少次年初次侵染来源；与禾本科、豆科等作物进行三年以上轮作；增施基肥，适当追肥，进行配方施肥，使植株生长健壮，提高抗病能力，减轻病害发生；干旱时及时灌水。种子消毒是预防病虫害较经济有效的方法，可用高锰酸钾300倍液浸泡2小时、木醋液200倍液浸泡3小时、石灰水100倍液浸泡1小时或硫酸铜100倍液浸泡1小时，消毒后温汤浸种4小时。选用优良抗病品种，轮作倒茬，合理密植。增施腐熟农家肥辅以复合肥，培強抗病能力，遇干旱或连阴雨，应及时抗旱与排水并实行茬口轮作。
