苹果轮纹病主要为害枝干和果实。枝干染病初期以皮孔为中心形成水渍状、近圆形、褐色斑点，逐渐扩大成扁圆形或椭圆形红褐色病斑，病斑质地坚硬，中心突起，边缘龟裂翘起如马鞍状，使枝干表面显得粗糙（故称粗皮病）。后期病斑中央产生小黑点，边缘裂缝加深，多个病斑密集时树皮呈粗皮状。严重时病害扩展到木质部，削弱树势，造成枝条枯死甚至毁园。
果实受害初期以果点为中心出现浅褐色圆形斑，逐渐扩大形成深浅相间的同心轮纹状病斑，外缘有明显的淡色水渍圈。病斑扩展后果肉腐烂，溢出茶褐色粘液，有酸腐气味。后期病斑表面形成散生的小黑点，不突破表皮。烂果失水后干缩变成黑色僵果。
叶片受害较少，发病时也以皮孔为中心形成褐色病斑。该病在7-8月果实膨大期易发，初期植株抗性强，随着果实生长病菌易侵入。
